Костенко Дмитрий Олегович (Аспирант, младший научный сотрудник
Национальный исследовательский
ядерный университет «МИФИ» (Москва),
Федеральный исследовательский центр
«Фундаментальные основы биотехнологии» РАН (Москва)
)
Коротков Евгений Вадимович (Доктор биологических наук, профессор
Национальный исследовательский
ядерный университет «МИФИ» (Москва),
Федеральный исследовательский центр
«Фундаментальные основы биотехнологии» РАН (Москва)
)
Короткова Мария Александровна (Кандидат технических наук, доцент
Национальный исследовательский
ядерный университет «МИФИ» (Москва)
)
| |
Поиск оптимального множественного выравнивания символьных последовательностей требует затраты большого объёма вычислительных ресурсов. Ранее нами был разработан метод MAHDS, способный строить статистически значимые выравнивания слабо гомологичных последовательностей. В данной работе представлена архитектура и некоторые детали программной реализации системы для построения множественных выравниваний этим методом. Описан эффективный иерархический подход, использующийся для распределения вычислений в среде MPI кластера. Предложен способ обеспечения безопасного доступа конечного пользователя системы к ресурсам вычислительного кластера.
Ключевые слова:множественное выравнивание, распределённые вычисления, вычислительный кластер, MPI, thread pool
|
|
| |
|
Читать полный текст статьи …
|
Ссылка для цитирования:
Костенко Д. О., Коротков Е. В., Короткова М. А. РАСПРЕДЕЛЁННАЯ СИСТЕМА ДЛЯ ПОСТРОЕНИЯ МНОЖЕСТВЕННЫХ ВЫРАВНИВАНИЙ СИМВОЛЬНЫХ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ МЕТОДОМ MAHDS // Современная наука: актуальные проблемы теории и практики. Серия: Естественные и Технические Науки. -2025. -№05/2. -С. 73-78 DOI 10.37882/2223-2966.2025.05-2.13 |
|
|
